奇门遁甲的流派很多，运用方式也各有侧重。

　　从功能上，可分为“法术奇门”、“方位奇门”、“占卜奇门”。“法术奇门”侧重于玄学符令的应用，久已失传。“方位奇门”和“占卜奇门”使用率比较高。

　　从布局方式上，可分为“年家奇门”、“月家奇门”、“日家奇门”、“时家奇门”等常见流派。

　　“年家奇门”以年为主布局，“月家奇门”以月为主布局，“日家奇门”以日为主布局。“时家奇门”以具体时间来布局，使用范围最广。“年家奇门”和“月家奇门”

　　只用阴局，“日家奇门”和“时家奇门”阴阳局都用。

　　从盘式上，可分为“转盘奇门”和“飞盘奇门”两类。“转盘奇门”是依照天体运转的规律去排盘，实际是对天体进行模拟。而“飞盘奇门”是按照九宫格去排盘，实际是感应气流磁场的规律。

　　从起局方式上，可分为“置闰法”、“拆补法”和“茅山道人法”。

　　除此之外还有其他划分法。各大流派在断局方式上也有不同，有的用神比较灵活，有的用神比较固定。