数层组合太极图与阴阳鱼互纠式太极图原理一样，都体现了阴阳两极的互生互利，只是所绘制的图案不同而已。

　　关于数层组合太极图的起源，历朝也有很多不同说法，至今仍有争议。

　　北宋的潘兴嗣认为此图源自周敦颐：“(周敦颐)尤善谈名理，深于易学，作太极图、易说、易通，数十篇。”这种观点也得到了朱熹的认可。

　　南宋的朱震认为此图源自陈抟：“陈抟以先天图传种放，放传穆修……穆修以太极图传周敦颐，敦颐传程颢、程颐。”

　　宋元之际的刘因认为此图源于佛徒寿涯：“而或又谓周子与胡宿、邵古同事润州一浮屠而传其易书。”

　　清代的毛奇龄认为此图源于《道藏·上方大洞真元妙经图》：“或云其图在隋唐之间，有道士作《真元品》者，先窃其图人《品》中，为太极先天之图，此即抟之窃之所自始，且称名有‘无极’二字，在唐玄宗序中。”现代的冯友兰、侯外庐等学者都认可这种说法。